
腺相关病毒(AAV)的反向末端重复序列(Inverted Terminal Repeat, ITR)是其基因组两端的对称重复序列,具有多种关键功能,具体如下:
1、复制起点与DNA合成
ITR包含病毒DNA复制的起始位点。其发夹结构允许病毒利用宿主细胞的DNA聚合酶进行链置换合成,形成双链DNA中间体。这一过程对病毒基因组的复制至关重要,尤其在辅助病毒存在时启动AAV的复制。
2、基因组包装信号
ITR是病毒基因组包装到衣壳中的必需信号。其形成的二级结构(如发夹)可被衣壳蛋白识别,确保基因组正确包裹。ITR缺失会导致病毒无法有效包装。
3、单链DNA的形成与稳定性
ITR的自我互补特性促进单链病毒DNA的环化或双链形成,增强基因组在宿主细胞内的稳定性,尤其在重组AAV载体中帮助转基因持久表达。
4、整合与位点特异性(野生型AAV)
野生型AAV的ITR介导其整合至人类19号染色体的特定位点(AAVS1),依赖Rep蛋白与ITR的相互作用。但重组AAV载体通常去除Rep基因,故丧失整合能力,降低插入突变风险。
5、载体构建中的功能保留
在基因治疗载体中,ITR被保留以维持基因组稳定性和高效包装,而病毒结构基因被替换为目标基因,确保安全递送。
ITR是AAV基因组的核心调控元件,主导复制、包装及基因组稳定性,同时参与野生型病毒的位点特异性整合。重组载体中,ITR的功能聚焦于维持载体完整性和高效递送转基因,是AAV作为基因治疗工具的关键组成部分。
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